De acordo com a Organização Mundial da Saúde (OMS), em países de baixa e média renda, que concentram 90% da população infectada, desde 2003 observa-se um crescimento moderado (de 5% a 15%) na resposta ao tratamento devido à resistência. Isso acontece por diversos motivos, começando pela característica muito peculiar do HIV, um vírus altamente mutante, capaz de enganar as drogas e o sistema imunológico. É por isso que os remédios são ministrados em forma de coquetéis com pelo menos três substâncias diferentes. A adesão ao tratamento é outro fator extremamente importante: se deixar de tomar os antirretrovirais nos dias e nos horários certos, o paciente está abrindo caminho para novas mutações, pois a pressão que a droga exerce sobre o medicamento fica comprometida.