Investigações realizadas à época do acidente em solo africano, conduzidas por técnicos do Instituto Moçambicano de Aviação Civil, reveleram que o piloto da aeronave, Herminio dos Santos Fernandes, teve a "intenção clara" de derrubar o avião, segundo o responsável pelo órgão, João Abreu.
[SAIBAMAIS]As gravações da caixa-preta revelaram que a queda ocorreu após o comandante acionar o piloto automático e se trancar na cabine, impedindo a entrada do copiloto e ignorando sinais de alerta emitidos pelo sistema da aeronave. A altitude e velocidade do avião também foram alteradas manualmente por ele. De acordo com João Abreu, durante essa sequência de atos do piloto "é possível ouvir alarmes de alta intensidade e a tentativa de alguém entrar na cabine com constantes batidas na porta".
O comandante tinha experiência de mais de 9 mil horas de voo e sua licença havia sido renovada em abril de 2012. As razões que podem ter dado origem ao seu comportamento são até hoje desconhecidas.